GR-CITRUSはピン数の少ないボードに機能を詰め込むため、1つのピンがRXマイコンの複数のピンに接続されていることがある。またDAC出力の9番ピンおよびADC入力のA0～A3ピンは、ジャンパJ1～J5をショートすることでRXマイコンの他のピンにも接続される。(アナログ信号のピンのため、デフォルトでは不要な負荷が接続されないようにジャンパがオープンになっているものと思われる。)
そのため、RXマイコンのペリフェラルをArduinoライブラリを介さずに直接制御して利用したい場合、GR-CITRUSのどのピンがRXマイコンのどのピンとどのピンに接続されていて、どの機能が割り当て可能かをよくよく調べる必要がある。RXマイコンのペリフェラルの中でもとりわけ用途が多岐にわたるMTUとTPUについて、ピン機能の対応表を作成した。
詳細は、「RX63Nグループ、RX631グループ ユーザーズマニュアル ハードウェア編」の「22. マルチファンクションピンコントローラ（MPC）」を参照。
